Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPT2Q8TD30 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPT2Q8TD30 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms