Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms