Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
COLGALT1Q8NBJ5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLGALT1Q8NBJ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms