Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms