Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L2Q8NAA4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms