Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC155Q8N6L0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC155Q8N6L0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms