Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Z5

KCTD17, BTB/POZ domain-containing protein KCTD17, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD17Q8N5Z5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD17Q8N5Z5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD17Q8N5Z5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms