Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms