Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX18

DHX40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX40Q8IX18 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX40Q8IX18 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX40Q8IX18 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms