Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NME9Q86XW9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME9Q86XW9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms