Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKAP1Q86WV1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms