Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms