Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms