Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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