Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR3Q6ZT12 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBR3Q6ZT12 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms