Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms