Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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