Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTR9Q6PD62 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms