Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PRMT7-206ENST00000562381 713 ntTSL 213.3□□□□□ -0.284e-8■■■■■ 37.5
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PRPF8Q6P2Q9 LARS-215ENST00000514104 509 ntTSL 25.62□□□□□ -1.512e-17■■■■■ 37.5
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PRPF8Q6P2Q9 WDR43-205ENST00000446643 579 ntTSL 47.57□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 37.5
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PRPF8Q6P2Q9 PPP1R7-216ENST00000479821 213 ntTSL 56.44□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 B4GALT4-204ENST00000459820 582 ntTSL 36.3□□□□□ -1.45e-8■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 B4GALT4-206ENST00000460395 620 ntTSL 46.05□□□□□ -1.445e-8■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MFSD8-225ENST00000641369 641 nt5.24□□□□□ -1.571e-36■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.627e-19■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 IDE-208ENST00000496903 1867 ntTSL 24.6□□□□□ -1.678e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.11□□□□□ -1.751e-36■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 METTL6-205ENST00000453819 615 ntTSL 34.05□□□□□ -1.767e-19■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 METTL6-208ENST00000489881 618 ntTSL 33.84□□□□□ -1.797e-19■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 KARS-208ENST00000566772 644 ntTSL 23.48□□□□□ -1.855e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 EXOC6-206ENST00000495132 1799 ntTSL 23.45□□□□□ -1.865e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.888e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 PMPCB-208ENST00000498530 1161 ntTSL 22.84□□□□□ -1.968e-13■■■■■ 37.3
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