Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP5Q6NZY7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP5Q6NZY7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms