Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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