Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF18Q5VWM3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms