Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms