Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf135Q5VTT2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms