Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPRD2Q5VT52 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms