Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms