Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms