Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD12Q587J7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms