Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms