Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC1Q4VXA5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC1Q4VXA5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms