Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms