Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms