Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NFE2Q16621 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFE2Q16621 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms