Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms