Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F4Q16254 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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