Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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