Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
NCOA1Q15788 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
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NCOA1Q15788 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
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NCOA1Q15788 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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NCOA1Q15788 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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NCOA1Q15788 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
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NCOA1Q15788 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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NCOA1Q15788 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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