Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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