Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOMM20Q15388 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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