Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCLAFQ15004 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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