Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCAPQ14761 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRCAPQ14761 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms