Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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