Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM25Q14258 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms