Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2H2Q13888 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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