Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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PTCH1Q13635 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
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PTCH1Q13635 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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PTCH1Q13635 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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PTCH1Q13635 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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PTCH1Q13635 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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PTCH1Q13635 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
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