Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTMR3Q13615 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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