Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms