Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB3Q13509 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TUBB3Q13509 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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