Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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