Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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